Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msx3P70354 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx3P70354 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms