Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfi1P70338 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms