Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux2P70298 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux2P70298 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux2P70298 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux2P70298 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux2P70298 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms