Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp3P70281 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms