Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfixP70257 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfixP70257 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NfixP70257 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfixP70257 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfixP70257 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfixP70257 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfixP70257 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfixP70257 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfixP70257 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfixP70257 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfixP70257 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfixP70257 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms