Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uba52P62984 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uba52P62984 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uba52P62984 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms