Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl18aP62717 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl18aP62717 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms