Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp46P62069 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp46P62069 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp46P62069 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp46P62069 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp46P62069 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp46P62069 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp46P62069 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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