Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms