Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms