Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr3bP59470 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms