Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms