Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P58686 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P58686 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P58686 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P58686 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P58686 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P58686 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P58686 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P58686 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P58686 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P58686 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P58686 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P58686 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P58686 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P58686 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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P58686 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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P58686 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P58686 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P58686 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P58686 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P58686 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P58686 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P58686 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P58686 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P58686 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P58686 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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