Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bace1P56818 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bace1P56818 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bace1P56818 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bace1P56818 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms