Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms