Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a3P56564 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms