Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms