Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms