Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GemP55041 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GemP55041 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GemP55041 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GemP55041 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GemP55041 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GemP55041 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GemP55041 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GemP55041 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GemP55041 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GemP55041 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GemP55041 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GemP55041 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GemP55041 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms