Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn5P54830 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptpn5P54830 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms