Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms