Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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