Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dbx1P52950 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dbx1P52950 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms