Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna1P52793 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna1P52793 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms