Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms