Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ApodP51910 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ApodP51910 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApodP51910 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApodP51910 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApodP51910 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApodP51910 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApodP51910 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApodP51910 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApodP51910 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApodP51910 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApodP51910 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms