Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfP51642 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfP51642 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms