Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RorcP51450 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RorcP51450 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RorcP51450 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RorcP51450 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms