Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FmodP50608 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FmodP50608 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FmodP50608 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FmodP50608 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FmodP50608 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms