Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpbP50405 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpbP50405 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms