Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LmnaP48678 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LmnaP48678 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms