Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GdnfP48540 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GdnfP48540 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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