Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms