Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Abcd1P48410 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms