Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgfaP48030 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TgfaP48030 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TgfaP48030 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TgfaP48030 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TgfaP48030 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms