Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl6P47911 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl6P47911 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms