Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax9P47242 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax9P47242 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax9P47242 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax9P47242 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pax9P47242 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax9P47242 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax9P47242 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms