Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkn1bP46414 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms