Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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