Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms