Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Traf2P39429 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms