Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik2P39087 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms