Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtlP38585 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtlP38585 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtlP38585 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtlP38585 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtlP38585 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtlP38585 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtlP38585 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TtlP38585 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtlP38585 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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TtlP38585 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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TtlP38585 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TtlP38585 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtlP38585 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms