Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig1P37913 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms