Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn1P35821 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms