Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddit3P35639 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms