Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab21P35282 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab21P35282 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab21P35282 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms