Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptpn11P35235 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptpn11P35235 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms