Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptk2P34152 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms