Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms